急性中耳炎以全身用药和局部用药结合为主，慢性中耳炎以局部用药为主。全身用药主要包括口服或者静脉用抗生素，局部用药则包括清洗脓液的药物、消炎杀菌类药物，以及收缩鼻腔、开放咽鼓管类药物。
流脓停止、耳内完全干燥后穿孔或可自愈，穿孔不愈者可行鼓膜修补术或鼓室成形术。局部用药，需根据不同病变情况选用药物：
（1）鼓室粘膜充血、水肿，有脓液或粘脓时，用抗生素水溶液或抗生素与类固醇激素类药物混合液，如0.25%氯霉素液、氯霉素可的松液、3%洁霉素液、1%黄连素液等。
（2）用药前先清洗外耳道及中耳腔内脓液，可用3%双氧水或硼酸水清洗，后用棉花签拭净或以吸引器吸尽脓液，方可滴药。抗生素滴耳剂宜参照中耳脓液的细菌培养及药物敏感试验结果，选择适当药物。氨基糖甙类抗生素用于中耳局部可引起内耳中毒，应慎用或尽量少用。粉剂宜少用，粉剂应颗粒细、易溶解，一次用量不宜多，鼓室内撒入薄薄一层即可。穿孔小、脓液多者忌用，因粉剂可堵塞穿孔，妨碍引流。