呼吸内科的历史最早可追溯到1946年，当时称为同济医院肺科，主要研究和诊治对人民群众健康危害最大的结核病和呼吸系统感染性疾病。自二十世纪70年代以来，在慢性阻塞性肺疾病(COPD)、肺动脉高压、肺心病、支气管哮喘、肺癌的诊断和治疗方面进行了卓有成效的研究工作。1996年以前，曾经承担包括国家“七五”、“八五”重点科技攻关和WHO合作项目在内的多项重要科研项目，取得10多项重要的科研成果，。本学科点于1978、1981年先后被批准为全国首批呼吸内科学硕士和博士学位授予点，，2001年成立华中科技大学同济医学院呼吸疾病研究所，。
本学科点自80年代初至今一直参加全国高等医学院校统编教材的编写工作。、中华医学会呼吸病分会副主任委员、中华结核和呼吸杂志副主编等重要学术职务;张珍祥教授曾担任中华医学会呼吸病分会常务委员兼COPD学组组长、中华结核和呼吸杂志常务编委等重要学术职务;现学科带头人徐永健教授目前担任中华医学会呼吸病分会副主任委员兼COPD学组组长、中国医师协会呼吸医师分会副主任委员、中华结核和呼吸杂志副总编辑、、华中科技大学同济医学院呼吸疾病研究所所长、。
呼吸内科的医师由2000年前的8人增加到现在的22人，其中具有博士学位的有14人(占学科人员的64%)，具有副高以上职称的有16人(占学科人员的73%)，其中具有正高级职称的有6人。目前呼吸内科主任为赵建平教授，副主任为刘辉国教授和刘先胜教授。
呼吸内科病房由2000年的半个病区、32张床位发展到目前拥有2个病区、84张床位(包括RICU 10张床位)，并拥有多台先进的设备仪器，主要有全套呼吸重症监护病房(RICU)设备，12台先进的有创呼吸机，14台先进的无创呼吸机，2套睡眠监测系统，5套纤维支气管镜系统，4套肺功能仪等。呼吸内科的年门诊量由2001年的大约7万人次增加到2009年的大约13万人次，年住院人数由2001年的1300人次增加到2009年的2056人次。
呼吸内科科临床基地直接为湖北省及临近的河南、江西、湖南等省的呼吸系疾病患者提供了优质服务，还为国家级重大临床研究项目提供技术支撑平台，并培养了多名呼吸内科专科进修医师，为湖北省和邻近数省的呼吸内科专业的发展做出较大贡献。
科室建设的根本目的是服务社会，本学科在中南地区呼吸学界居龙头地位，目前年门诊量超过13万人次，年住院人数超过2000人次，并且收治的患者大部分患有呼吸系统的急危重症或疑难疾病。本学科为湖北省以及周边省份人民群众的呼吸疾病的诊治做出了重要贡献，间接促进了区域经济建设和社会发展;
本学科的努力工作为我国呼吸学科的发展做出了重要贡献，在学术界占有重要地位。本学科取得了多项高质量的科研成果，提高了我国呼吸内科学的科研水平，部分研究成果为卫生管理部门政策的制订提供了科学依据。
本学科通过招收进修生和研究生的方式，为湖北省和其他省份医院的呼吸内科培养了大批临床和科研骨干，带动了这些单位呼吸学科的发展。值得一提的是，本学科利用同济医院与新疆石河子大学医学院的关系，积极支持和扶持西部开发和建设，培训相关人员，带动新疆石河子大学医学院的相关学科发展，使其早日步入新的台阶，为我国呼吸内科学的发展做出了重要贡献。